殘胃癌需要與十二指腸潰瘍、殘胃炎、胃潰瘍等疾病鑒別。

1、十二指腸潰瘍：部分殘胃癌也可出現類似十二指腸潰瘍的癥狀，按十二指腸潰瘍治療，癥狀也可暫時緩解并被忽略，故需行胃鏡檢查鑒別，以免誤診。

2、殘胃炎：胃大部切除術后的慢性胃炎，也可出現上腹疼痛、進食后飽脹等癥狀，且常作為殘胃癌發生前的病變，但仍需與之通過胃鏡檢查鑒別。

3、胃潰瘍：胃大部切除術未能切除足夠胃組織或迷走神經，切斷不完全均可造成潰瘍復發，出現反復上腹部疼痛、飽脹、反酸等癥狀，胃鏡檢查可明確診斷。