中心現(xiàn)有正式職工104人，內(nèi)設(shè)辦公室、人教科、檢驗(yàn)科、計(jì)免科、艾滋病防治科、疫情信息科、急性傳染病防治科、慢性病防治科、職業(yè)病防治科、結(jié)核病防治科、公共衛(wèi)生科、宣教科、地方病科、疫苗管理科、體檢中心、美沙酮替代治療門診、預(yù)防接種中心；下設(shè)相山、杜集、烈山、三區(qū)疾控分中心。現(xiàn)有房屋建筑面積6070平方米，其中實(shí)驗(yàn)室面積2584平方米。淮北市疾控中心近年獲得各類省級(jí)、國(guó)家級(jí)榮譽(yù)20余項(xiàng)，并在2010年獲得由國(guó)家衛(wèi)生部、藥監(jiān)局、醫(yī)管局連合下文的全國(guó)醫(yī)藥衛(wèi)生先進(jìn)集體、省科技廳乳與乳制品中三聚氰酸檢測(cè)方法科技成果獎(jiǎng)、省性病疫情管理優(yōu)秀獎(jiǎng)、省禁毒工作先進(jìn)集體、全國(guó)HIV-1病毒載量檢測(cè)能力驗(yàn)證證書、全省艾滋病檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量考評(píng)優(yōu)秀、艾滋病病毒感染者/病人管理工作質(zhì)量獎(jiǎng)等榮譽(yù)。中心擁有萬元以上各類檢驗(yàn)檢測(cè)設(shè)備78臺(tái)件，如氣相色譜儀、氣相色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀、高效液相色譜儀、超高效液相色譜三重四極桿質(zhì)譜聯(lián)用儀、原子吸收分光光度計(jì)、原子熒光分光光度計(jì)、流式細(xì)胞儀、病毒載量?jī)x、全自動(dòng)生化分析儀、半自動(dòng)核酸提取儀等大型儀器設(shè)備。通過省級(jí)計(jì)量認(rèn)證，現(xiàn)在可開展食品安全、飲水安全、職業(yè)安全、傳染病、衛(wèi)生細(xì)菌學(xué)、健康體檢等方面檢測(cè)項(xiàng)目280余項(xiàng)。