中心的前身是綿陽市衛生防疫站，始建于1963年，位于綿陽市高新區綿興東路50號。2001年10月15日經批復組建綿陽市疾病預防控制中心，是綿陽市人民政府舉辦的負責全市疾病預防控制和公共衛生技術管理與服務的正縣級社會公益一類衛生事業單位，2014年10月創建成為“三級甲等”疾控中心。具體負責全市流行病學與地方病、職業病、慢性非傳染性疾病、免疫規劃、病媒生物、健康教育、衛生監測等政府防控疾病策略的實施和技術服務工作。能獨立承擔食品與健康相關產品、公共場所、學校、職業場所、放射裝置與設施等的衛生學檢測和技術管理與服務工作。中心占地面積23畝，建筑面積21600平方米。現有超高效液相色譜飛行時間質譜聯用儀、超高效液相三重串聯四級桿質譜聯用儀、三重四級桿氣相色譜質譜聯用儀、微生物質譜檢測儀、基因測序儀等檢驗檢測儀器設備767臺（件）。已取得檢驗檢測機構資質認定、職業衛生、放射衛生技術服務機構等資質，率先在全省建立了流感、結核藥敏、艾滋病等專業實驗室；建有3個市級重點實驗室，1個市級重點專科；近5年年均發表論文48篇，獲得科研立項9項，獲得省科技進步二等獎1項、三等獎1項，市科技進步二等獎1項；是四川大學、西南醫科大學等6所高等院校教學實習基地，也是綿陽市預防醫學會會長單位。