呼倫貝爾學院前身是始建于1958年的呼倫貝爾大學，1977年恢復本專科招生。1992年，呼倫貝爾盟教育學院、內蒙古廣播電視大學呼倫貝爾盟分校、呼倫貝爾管理干部學院、海拉爾師范專科學校合并，重新組建成立呼倫貝爾大學。1997 年，經原國家教委批準成立呼倫貝爾學院。2000年后，海拉爾蒙古族師范學校、呼倫貝爾盟商業學校、呼倫貝爾盟城建職工中專學校、內蒙古工程技術學校相繼并入。2003年，經教育部批準晉升為本科高校。2011年通過了教育部本科教學工作合格評估。2016年，被內蒙古自治區教育廳、發改委、財政廳列為轉型發展試點高校，同年入選國家“十三五”應用型本科產教融合發展工程百所高校。學校現有兩個校區，占地101.69 萬平方米，建筑面積 32.91 萬平方米，教學行政用房18.32 萬平方米，館藏紙質圖書 109.21 萬冊、電子圖書 140.70 萬冊、數據庫 14 個。學校設有23個學院、18個黨政管理機構、3 個教輔部門和民族歷史文化研究院。現有本科專業 54 個，涵蓋文學、藝術學、理學、教育學、法學、工學、歷史學、管理學、經濟學和農學十大學科門類。