重慶兒童醫院重慶醫科大學附屬兒童醫院于1956年由上海醫學院兒科系遷渝創建，是集醫教研為一體的國家三級甲等綜合性兒童專科醫院、是全國兒科學重點學科，是最早被國家授予兒科學碩士、博士學位授予點、博士后流動站的單位，曾兩次被評為全國衛生系統先進集體、全國精神文明建設工作先進單位和獲全國青年文明號稱號。

醫院核定床位800張，年門診量90多萬人次，住院患兒3萬余人次。現有教職員工1242人，博士生導師21名、高級職稱專家180名、享受政府特殊津貼專家12名。是中華醫學會兒科學分會、兒外科分會領導成員，中華兒科雜志主編和全國兒科學統編教材主編、副主編單位，有26人在中華醫學會兒科相關學組及其他全國性醫學專業學組中擔任學術職務。

醫院專業設置齊全，是重慶唯一的兒童涉外醫院，全國聯網的兒童急救中心。是重慶市哮喘防治中心、激光應用中心、危重新生兒及早產兒急救中心。共有28個臨床和醫技科室，主要專業涉及兒內科、兒外科、感染消化科、急診科、耳鼻喉科、眼科、心理科等。其中兒童免疫缺陷病、腦電生理、外周神經疾病、白血病與實體腫瘤、營養與生長發育、過敏性疾病診治在全國享有盛譽。新生兒疾病、難治性肺炎、活體肝移植術、小年齡復雜先心手術治療、泌尿生殖畸形、骨科矯治在西部兒科界領先。

兒科學院承擔著兒科醫學、護理學各層次學生及進修生等教學任務，每年在讀碩、博士研究生近200名，進修生100余名；醫院實行住院醫師、臨床護士、醫技、管理人員規范化培訓，是衛生部指定的兒科醫學生畢業后培訓基地之一。
重慶醫科大學兒科研究所為醫院科研的重要基地。兒童臨床免疫、神經、腫瘤、營養和急救學的研究居全國前列，部分研究達國際先進水平。近五年承擔國家自然科學基金重點課題和面上項目居全國兒科界首位，承擔國家“863”合作課題2項、“國家科技支撐計劃”合作項目3項，“十五”攻關合作課題、美國NIH和國際營養研究基金課題多項，與上海交通大學BIO-X中心合作，成功發現重慶彭水矮人家族新的基因突變點，發表CSCD核心庫和SCI論文500余篇，曾獲國家科技進步二等獎、國家發明二等獎及省部級科技進步獎30余項。

醫院高度重視對外交流，每年邀請外賓來院講學40余次，出國、出境中長期培訓、訪問、講學和出席國際會議50余人次。先后與美、英、加、日、澳、香港等20多個國家和地區醫學機構建立了友好協作關系，與全國尤其西部近50家醫療機構建立了協作或指導醫院關系。多次組團參加國際兒科年會為國爭光，近三年5次成功舉辦國際學術會議。

醫院將堅持“醫療立院、科技興院、人才強院、依法治院、文化建院”的方針，以兒童健康為中心，以為廣大兒童提供優質、高效、便捷服務為已任，立足重慶，面向西部，輻射全國，走向世界，為建設國內一流、在國際上有一定影響的兒童醫學中心而不懈奮斗。